科研進(jìn)展

華南植物園在安第斯皇后鳳梨保護(hù)基因組學(xué)研究獲新進(jìn)展

發(fā)布時(shí)間:2024-08-21 作者:scbg 來源:華南植物園

????安第斯皇后鳳梨(Puya raimondii Harms)是安第斯山脈特有的一種植物(圖1),分布在秘魯和玻利維亞3000—4800米的高山地帶。作為鳳梨科(Bromeliaceae)中最高大的物種,安第斯皇后鳳梨的植株高度可達(dá)15米,是安第斯普納地區(qū)(Puna)最為矚目的植物之一。該物種具有獨(dú)特的生活史性狀,壽命長達(dá)40—100年,且一生只開一次花,開花后便迅速死亡。隨著下一代測序技術(shù)(Next-Generation Sequencing)的發(fā)展,保護(hù)基因組學(xué)在物種保護(hù)中正發(fā)揮著越來越重要的作用。然而,針對長命單次繁殖植物的保護(hù)基因組學(xué)研究仍相對匱乏,影響了對這一類植物的保護(hù)。

????中國科學(xué)院華南植物園植物科學(xué)研究中心劉露等科研人員利用重測序(Resequencing)技術(shù)對來自秘魯?shù)?個(gè)群體,共計(jì)200個(gè)安第斯皇后鳳梨?zhèn)€體進(jìn)行了研究。研究利用全基因組數(shù)據(jù)分析群體的遺傳多樣性,利用溯祖法推斷群體動態(tài)歷史,并將結(jié)果與長命多次繁殖植物Puya macrura Mez進(jìn)行了比較。

????研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),安第斯皇后鳳梨的9個(gè)群體間高度分化(圖2),群體內(nèi)具有較低的遺傳多樣性和較高的遺傳負(fù)荷。盡管各個(gè)群體內(nèi)部缺乏遺傳變異,但平衡選擇在維持部分位點(diǎn)的遺傳多樣性方面發(fā)揮了重要作用。此外,安第斯皇后鳳梨和其近緣種P. macrura均在更新世受到強(qiáng)瓶頸作用的影響,隨后,P. macrura的群體規(guī)模逐漸恢復(fù),而安第斯皇后鳳梨的群體規(guī)模卻持續(xù)收縮(圖3)。研究表明,長命單次繁殖的生活史性狀可能影響植物的群體大小和基因組變異,使安第斯皇后鳳梨面臨較高的滅絕風(fēng)險(xiǎn),這一發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了在未來物種保護(hù)和管理中需充分考慮生活史的影響。

????該研究成果已近期發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊New Phytologist(《新植物學(xué)家》)上。華南植物園博士后劉露為論文的第一作者,葛學(xué)軍研究員和烏普薩拉大學(xué)的Martin Lascoux教授為共同通訊作者。該研究得到中國科學(xué)院“一帶一路”計(jì)劃、廣東省應(yīng)用植物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及國家留學(xué)基金委的資助。文章鏈接:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.20036

圖1. 安第斯皇后鳳梨

圖2. 安第斯皇后鳳梨9個(gè)群體的遺傳結(jié)構(gòu)

圖3. 基于FASTSIMCOAL2和PSMC推斷安第斯皇后鳳梨和Puya macrura的群體動態(tài)歷史。





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